先天性前列腺囊肿，为中肾导管与中肾旁管发育异常，管腔部分扩张而形成囊肿。起于中肾旁管的囊肿常位于前列腺后正中处，而起自中肾导管的囊肿则居于两旁。这种囊肿实际并非起自前列腺，常与膀胱后壁粘连。其体积往往可长到很大，压迫膀胱颈引起排尿困难；压迫直肠引起肛门坠胀感与排便困难。先天性前列腺囊肿常伴有尿道下裂、隐睾、肾发育不全等先天性疾病。
后天性前列腺囊肿，系由坚韧的前列腺基质导致腺泡不完全或间断性梗阻，逐渐使腺泡上皮变厚，终至发生潴留性囊肿，可位于前列腺内的任何部位或突出至膀胱颈部，直径为1-2cm。寄生虫性囊肿，由于寄生虫引起，如包虫能使前列腺管及周围发生慢性炎症，或由肉芽增生逐渐形成囊肿。
