一、包茎。这是指阴茎头部的皮肤长得太长，紧紧地覆盖包裹着阴茎头，而且包皮口很小，无法上翻露出阴茎头。这是一种最为常见的阴茎先天性畸形。
二、重复阴茎。这种畸形发生的机会远比包茎要少，在500万余例中仅出现1例。重复阴茎即长出两个或更多个阴茎，其中以双阴茎发生率最高，两个阴茎可以左右并列，也可以上下分开。有的两个阴茎各自有一条尿道分别通入一个膀胱，患者有重复膀胱畸形；有的是两条尿道通向一个正常膀胱。
三、隐匿阴茎。乍一看好像没有长阴茎，仔细检查才发现阴茎被隐匿地长在阴囊、会阴、股部或下腹部增厚的皮下脂肪里，而且这种阴茎发育不良，显得很小。这类畸形病人数量较少。
四、阴茎阴囊转位。又叫阴茎前阴囊。正常阴茎长在阴囊的前面，这种畸形病人却正好相反，阴茎长到了阴囊的后面，两者换了个位置。
