一、影响正常的生育。因为附睾结核是男性生殖系的一部分，男性生殖系结核往往几个器官一起发病，如果男性前列腺、精囊、输精管、附睾及睾丸中的一个器官出现问题，都会对生育功能产生影响，从而导致不育的发生。
二、影响精子质量。附睾是一种微细管道结构，它既是精子成熟和贮存的场所，同时也是精子进入输精管的通路，如果附睾受到结核菌的侵袭，就会破坏精子成熟、贮存的环境，使精子的活力降低，甚至造成附睾官腔堵塞，使精子不能正常通过。
三、危害输精管。患附睾结核长久不治，还会波及到输精管，使输精管摸上去高高低低，同时输精管腔也会因此堵塞，造成精子无法顺利进入精囊、射精管，就无法射出体外，最终影响男性正常的生育。
四、使双侧附睾受累。结合杆菌的原发病灶一般都在肺、肠道、淋巴腺、扁桃腺、肾脏、骨骼等部位，它们可通过下行感染或血行传播从而引发附睾结核的发病。这种情况往往容易引起双侧附睾受到威胁，进而造成男性不育的发生。
