病原体多为肠道致病菌，常规细菌学检查大约只有20%的患者查出细菌。最近研究表明，前列腺炎患者尿动力学检查发现后尿道压力增高，内服α拟肾上腺素能受体拮抗剂后症状减轻或消失，提示前列腺后尿道平滑肌能力增高，使尿液湍流，尿液反流入前列腺，尿液内的尿酸产生化学刺激，引起疼痛。病原体随尿液侵入前列腺，导致感染。病理解剖证实前列腺炎病变一般局限于外周带，此处腺管与尿流垂直线逆向开口于后尿道，易致尿液反流，而中央带及移行带腺管走向与尿流方向一致，不易发生感染。最近研究还发现尿液的尿酸盐不仅对前列腺有刺激作用，还可沉淀成结石，堵塞腺管，作为细菌的庇护场所。这些发现可以阐明前列腺炎综合征其实是多种疾病的共同表现，而且临床表现复杂多变，可产生各种并发症，也可自行缓解。
