一、尿痛常为发病的早期症状。尿道前部有烧灼感、刺痛或灼热辣痛，排尿时疼痛明显加剧，甚则向小腹或脊柱放射。夜间疼痛时，患者可发生阴茎的“痛性勃起”。
二、尿道口红肿溢脓经12-24小时后疼痛略微减轻，并开始排出稀薄的粘液样分泌物，量多，再经12-24小时，排出大量的脓性分泌物，24小时可排出脓汁20-50ml。2-3天后脓汁量减少，稠浓，颜色由白色变为黄白色或黄褐色，再经3-4天脓汁更少而浓稠，晨间由于脓液在尿道口聚集，形成脓膜，称为“糊口”，疼痛减轻，尿道口红肿，呈外翻状，包皮内叶也红肿，并可发展为包皮龟头炎，嵌顿包茎等。
三、尿频尿急与一般泌尿系感染类似，此因炎症而引起尿道括约肌收缩，尿频尿急以夜间为甚。另外，由于炎症波及该处的粘膜小血管，还常出现“终末血尿”。有时可有血精。
四、会阴部坠胀痛临床上出现会阴部坠胀疼痛，这提示病变已上行侵犯后尿道、前列腺和精囊等。
五、全身症状个别患者还会有全身症状，如发热(体温38℃左右)，全身倦怠无力、不适，食欲不振，甚至恶心、呕吐。
六、查体：尿道口及入状窝红肿充血、水肿，有时有小的、浅表性脓肿、糜烂或小溃疡。严重时尿道粘膜外翻，红肿波及整个阴茎头，龟头及包皮外翻，包皮无法上翻，压迫尿道可流出脓汁。两侧腹股沟淋巴结亦可受累引起红肿、痉痛、化脓，有明显压痛，并随着尿道炎症的减轻而减少，炎症消失后2-3天，淋巴结的炎症也随之消失。
七、病程演变：第一周症状最重，如不经治疗或治疗不及时、不彻底，约2-3周后症状逐渐减轻，尿道的分泌物减少，组织肿胀亦消退，一个月后症状完全消失。但淋菌此时已侵入深层腺体，甚至潜伏于瘢痕组织中缓慢生长，发展成为慢性淋病，后期可发生尿道狭窄。
